
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究探讨结果显示
学习人探究式用时推移冷库用时提升鸡肉的坚硬程度、持混流式水轮机、成色、分离铁含磷量、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4级别来测评腿部肌肉组织性癌细胞膜的铁伤亡环境。結果信息显示,冷库用时提升后,鸡肉的坚硬程度在第四天和第6天有效下调;持水业务能力减轻;配色变深,逐渐耗尽光亮,鲜颜色就来为暗颜色。除外,分离铁、化学活化氧和MDA的含磷量有效增添,癌细胞膜凋亡率有效提高。 学习工作人员转化成其他冷冻冷藏时光的背部肌样件的核营养素酶酶质含量,而后做好SDS-PAGE分享,核营养素酶酶质含量条带在其他南北朝时期布置均且相像(图1a)。可根据核营养素酶酶在其他样件中的呈现状态,分享找到统一组样件的中十位数介于于统一水准(图1b),代表背部肌样件核营养素酶酶质含量有正常的组内相像性和组间不一致性性。 核氨基酸组学共评定出1996种核氨基酸。以B0为對照组,筛分B1、B2、B4和B6中的核蛋清质酶去异同描述具体分析一下,共评定到377个DEPs。将火山图信息可视化,并据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根规范具体分析一下DEP。毕竟图甲1c-f形容出来,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别评定出22、33、73和140个DEPs,这里面分发型别上涨6、11、32和87个,下跌16、22、41和54个。聚类算法的方式考核了各种不同冷藏库过程健身肌肤团体中核氨基酸的描述,毕竟呈现健身肌肤核蛋清质酶描述异同逐渐存储的时间的加入而加入(图1g)。
图1| 不一样的冷库时间段的肌群合格品核营养素组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同的冷冻期限的腹肌图纸之间的关系血清具体分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消亡蛋白质肽的PRM化学发光法进行分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG丰度差异性展示核蛋白的铁窒息死亡管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT按量蛋清质组学新枝术售后服务保障,拜谱怪物已新产品设备研发完毕并搭建了落实成熟稳定的转录组学、蛋清组学、新陈代谢组学甚至多个学综合产品设备新枝术售后服务保障风险管理体系,欢迎致电咨询!
参阅资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.