
近日,扬州医科综合大学第1 加盟医疗王学浩博士管理团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗人体脂肪细胞代谢检测分析服务。
英语大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕微信标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客企业:南京医科大学
研究方案板材:细胞
拜谱可以提供服务性:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向疗法能力细胞代谢组
技术水平交通路线:
设计的结果
01、YBX1被评定为HCC中糖酵解的首要基因组
本分折采集工具HCC淋巴肿癌子样本(n=7)的单血细胞膜膜RNA测序动态统计数据集开展分折,遇到糖酵解灵活性关键聚焦在淋巴肿癌血细胞膜膜中,hdWGCNA分折判断出9个遗传基因控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的长期生存游戏下载分折判定YBX1为独力长期生存游戏下载危险要素要素(图1H)。进步结合在一起IHC、WB测试和淋巴肿癌聚集与紧邻非淋巴肿癌聚集的环境转录组学动态统计数据集声明YBX1是肝血细胞膜膜癌改善的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确保为调结HCC人体细胞糖酵解的的关键关键步骤
02、YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点电能新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1结合在一起并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1运用并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷碱化,以此增进其核转位
进第一步一个脚印探测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否需要影响到其磷过酸,在OGT敲低的HCC受损受损细胞中或用OGT缓和剂OSMI-1进行处理,YBX1蛋清技术平均品质取得减低,YBX1磷过酸取得缩减(图4A-C)。IP测试展示,在不同的Flag-YBX1底物技术平均品质下,YBX1-WT的磷过酸技术平均品质取得超出YBX1-T57A,反映出磷过酸的增大不只是仅是根据越高的YBX1蛋清把你想表达方法出来(图4D)。分离进行处理了核和质混合物察觉TMG进行处理的HCC受损受损细胞中YBX1核把你想表达方法出来的增高(图4E-F),进第一步一个脚印察觉YBX1磷过酸的要点上下调整成分是AKT(图4G-I)。他们察觉反复强调O-GlcNAc糖基化确认使得其磷过酸来增强学习YBX1蛋清不稳明确性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有助于于其进几步产生磷酸性反应遮盖并都可以推进其核转位
05、YBX1加快PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 要改善组核蛋白乳硝化作用掩盖水平面
理论研究发觉YBX1敲低偏态有效大幅度降低血清质乳硝化为用,更是是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解调节剂2-DG的实验操作核实了糖酵解与组血清乳硝化为用的会会关连,调节糖酵解可偏态有效大幅度降低H3K18la含量(图6D)。PKM2过抒发可逆反应转YBX1敲低所导致的H3K18la减少,以外源乳酸净化处理不光优化H3K18la,还存于YBX1抒发调整,提升存在着顺向跟进(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR核实,H3K18la根据含有于YBX1运行子会会有利于其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),高并发觉P300 调整是YBX1增強H3K18乳酰化为用的工作机制(图6K-L)。
图6.YBX1增加H3K18乳酸性反应装饰水平面
一篇文章总结ppt
在某项研究探讨中宣传报道了YBX1在HCC中高表述,且与糖酵破译切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,若想动态平衡淀粉酶质并添加其表述。各种掩盖还驱动安装YBX1在T57处的磷过酸,驱动安装其核易位。对此,某一时增強了糖酵解涉及到的染色体的转录并激发乳酸的带来。不但,YBX1成功激活P300的转录,从根本上驱动安装组淀粉酶的乳过酸,特别的是H3K18la,H3K18乳过酸领域调节管控YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传正负极馈环措施图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点热量分解代谢组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、翻泽后突显组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考选取文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.