
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化突显蛋清组学产品,实现1000+举重若轻度绘制位点检测出,增强再次出现经典的靶点,全方向生信数据分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“核验”全方案服務,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、科学实验程序流程
02、监测动态数据
03、经“点”复现
在评测大数据中,排除多参考文献中报道范文的原素靶点和其衣康酸遮盖位点,如1、个被出现的衣康酸共价遮盖核血清KEAP1,和糖酵解通道中的3个重要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及其炎性小体分解成核血清NLRP3和细胞膜萎缩方式中的重要点核血清RIPK3等,其质谱图正确图下图。
04、成品特性
1.多种质控
商业区化特男人测试探针孵育、SDS-PAGE测量、WB核实、子样本想关性分析一下等相互位测量,抓好产品的结果可信度性。2.高功效质谱设备app
在Orbitrap Astral全新这一代高判定质谱仪作明佛母心咒下,达成衣康过酸突显位点及核蛋白司法鉴定新深度1,转向生物学研究方案新知道。3.全过程站台式提供服务
立于拜谱生物技术不断完善的科学试验游戏平台,可能提供“生殖细胞塑造→探头孵育→WB的查重→深奥度衣康酸性反应掩盖的查重→个性化生信阐述→对应位点PRM安全验证”全工作流程服务培训,省时省劲、方便更省心省事。05、分折介绍(大部分)
06、操作位置
PART 2、参考文献分亨
论文资料一
日文标题文字:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译文章标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
理论研究方面:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献资料二
英语翻译主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
英文版微信标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究探讨玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、成功案例随之出现工作思路
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着具有的底物相结合专业能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱动物衣康酸性反应淡化组监测数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化表达(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
充当TCA循环往复中的正中间基础产生物,衣康酸设定基础产生、免疫性力检测和发炎双方的双方效用,为根治免疫性力检测发炎性急病带来了数据了混用根治机制。衣康酸组成中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸组成能对血清质上的可溶性半胱氨酸残基来烷基化绘制(迈克尔加强体现),此译员后绘制被誉为“衣康酸绘制(itaconation)”,因而导致血清质性能,国家宏观调控免疫性力检测回应和基础产生经由,为多类急病类药产品开发带来了数据新工作思路。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化修饰语蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医学可以说酶联免疫法靶向治疗基础代谢组(QMT1000)或能源新陈分泌靶向药物新陈分泌组新产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参照医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.